Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RTKNQ9BST9 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms