Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NICN1Q9BSH3 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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