Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GORASP1Q9BQQ3 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GORASP1Q9BQQ3 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms