Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 NAA15-201ENST00000296543 6222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
PMCHL2Q9BQD1 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms