Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SIN3AQ96ST3 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms