Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms