Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
COG3Q96JB2 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms