Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
BORCS6Q96GS4 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms