Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SCARF2Q96GP6 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms