Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
NMD3Q96D46 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NMD3Q96D46 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms