Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBXN4Q92575 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBXN4Q92575 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms