Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFP9

NBEA, Neurobeachin, humanhuman

Predictions only

Length 2,946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBEAQ8NFP9 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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NBEAQ8NFP9 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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NBEAQ8NFP9 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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NBEAQ8NFP9 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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NBEAQ8NFP9 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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NBEAQ8NFP9 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
NBEAQ8NFP9 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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