Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNNM3Q8NE01 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CNNM3Q8NE01 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CNNM3Q8NE01 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNNM3Q8NE01 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNNM3Q8NE01 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNNM3Q8NE01 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNNM3Q8NE01 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNNM3Q8NE01 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CNNM3Q8NE01 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms