Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms