Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATG4DQ86TL0 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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ATG4DQ86TL0 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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ATG4DQ86TL0 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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ATG4DQ86TL0 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ATG4DQ86TL0 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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