Protein–RNA interactions for Protein: Q71UI9

H2AFV, Histone H2A.V, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFVQ71UI9 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
H2AFVQ71UI9 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms