Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SUSD1Q6UWL2 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SUSD1Q6UWL2 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms