Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TAF11Q15544 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms