Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE3CQ15386 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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