Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SSPNQ14714 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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SSPNQ14714 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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SSPNQ14714 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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SSPNQ14714 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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SSPNQ14714 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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SSPNQ14714 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SSPNQ14714 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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