Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CTTNQ14247 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTTNQ14247 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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