Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDH18Q13634 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDH18Q13634 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
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