Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
XRCC4Q13426 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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