Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPRL3Q12980 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPRL3Q12980 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPRL3Q12980 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPRL3Q12980 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NPRL3Q12980 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPRL3Q12980 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NPRL3Q12980 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NPRL3Q12980 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NPRL3Q12980 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPRL3Q12980 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NPRL3Q12980 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NPRL3Q12980 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NPRL3Q12980 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NPRL3Q12980 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NPRL3Q12980 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
NPRL3Q12980 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NPRL3Q12980 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
NPRL3Q12980 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NPRL3Q12980 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NPRL3Q12980 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NPRL3Q12980 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
NPRL3Q12980 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NPRL3Q12980 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NPRL3Q12980 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NPRL3Q12980 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NPRL3Q12980 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NPRL3Q12980 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NPRL3Q12980 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NPRL3Q12980 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NPRL3Q12980 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NPRL3Q12980 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NPRL3Q12980 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NPRL3Q12980 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
NPRL3Q12980 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NPRL3Q12980 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NPRL3Q12980 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
NPRL3Q12980 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
NPRL3Q12980 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NPRL3Q12980 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
NPRL3Q12980 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NPRL3Q12980 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
NPRL3Q12980 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms