Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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FOXD4Q12950 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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FOXD4Q12950 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FOXD4Q12950 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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