Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TROQ12816 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TROQ12816 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TROQ12816 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TROQ12816 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TROQ12816 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TROQ12816 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TROQ12816 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TROQ12816 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TROQ12816 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TROQ12816 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TROQ12816 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TROQ12816 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TROQ12816 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TROQ12816 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TROQ12816 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TROQ12816 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TROQ12816 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TROQ12816 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TROQ12816 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TROQ12816 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TROQ12816 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TROQ12816 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TROQ12816 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TROQ12816 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TROQ12816 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TROQ12816 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TROQ12816 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TROQ12816 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TROQ12816 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TROQ12816 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TROQ12816 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TROQ12816 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TROQ12816 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TROQ12816 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TROQ12816 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TROQ12816 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TROQ12816 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TROQ12816 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TROQ12816 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TROQ12816 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TROQ12816 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TROQ12816 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TROQ12816 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TROQ12816 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TROQ12816 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TROQ12816 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TROQ12816 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TROQ12816 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TROQ12816 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TROQ12816 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TROQ12816 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TROQ12816 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TROQ12816 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TROQ12816 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TROQ12816 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TROQ12816 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TROQ12816 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TROQ12816 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TROQ12816 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TROQ12816 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TROQ12816 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TROQ12816 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TROQ12816 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TROQ12816 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TROQ12816 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TROQ12816 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TROQ12816 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TROQ12816 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TROQ12816 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TROQ12816 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TROQ12816 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TROQ12816 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TROQ12816 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TROQ12816 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TROQ12816 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TROQ12816 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TROQ12816 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TROQ12816 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TROQ12816 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TROQ12816 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TROQ12816 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TROQ12816 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TROQ12816 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TROQ12816 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TROQ12816 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TROQ12816 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TROQ12816 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TROQ12816 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TROQ12816 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TROQ12816 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TROQ12816 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TROQ12816 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TROQ12816 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TROQ12816 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TROQ12816 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TROQ12816 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TROQ12816 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TROQ12816 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TROQ12816 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
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