Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
EFEMP1Q12805 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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