Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SYCNQ0VAF6 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
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