Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CYP4F3Q08477 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms