Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LOXL1Q08397 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LOXL1Q08397 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LOXL1Q08397 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LOXL1Q08397 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LOXL1Q08397 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LOXL1Q08397 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LOXL1Q08397 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LOXL1Q08397 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LOXL1Q08397 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LOXL1Q08397 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LOXL1Q08397 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LOXL1Q08397 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LOXL1Q08397 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LOXL1Q08397 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LOXL1Q08397 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LOXL1Q08397 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LOXL1Q08397 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
LOXL1Q08397 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LOXL1Q08397 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
LOXL1Q08397 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LOXL1Q08397 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
LOXL1Q08397 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
LOXL1Q08397 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LOXL1Q08397 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LOXL1Q08397 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LOXL1Q08397 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
LOXL1Q08397 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
LOXL1Q08397 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms