Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RUNX1T1Q06455 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms