Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPN12Q05209 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPN12Q05209 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms