Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 MS4A3-202ENST00000358152 1516 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 AP000844.2-201ENST00000419440 509 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 AL133216.1-201ENST00000428915 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 AC017100.1-201ENST00000565978 1169 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 MAGEB5-201ENST00000602297 1216 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 OR8D2-201ENST00000624618 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 PSMC1P9-201ENST00000396338 1335 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 PSMC1P1-201ENST00000478110 1320 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 THAP6-210ENST00000507557 542 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 CCDC60-203ENST00000536742 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CACNB1Q02641 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms