Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
IRF9Q00978 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
IRF9Q00978 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms