Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDKL1Q00532 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms