Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TFAMQ00059 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TFAMQ00059 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms