Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNAP25P60880 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms