Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CTBP2P56545 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms