Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNTBP49356 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FNTBP49356 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNTBP49356 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNTBP49356 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNTBP49356 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNTBP49356 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNTBP49356 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNTBP49356 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNTBP49356 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNTBP49356 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNTBP49356 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNTBP49356 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNTBP49356 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNTBP49356 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNTBP49356 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FNTBP49356 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNTBP49356 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNTBP49356 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNTBP49356 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNTBP49356 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNTBP49356 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNTBP49356 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FNTBP49356 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTBP49356 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTBP49356 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTBP49356 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTBP49356 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTBP49356 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTBP49356 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTBP49356 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTBP49356 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTBP49356 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTBP49356 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTBP49356 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTBP49356 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTBP49356 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTBP49356 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTBP49356 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTBP49356 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTBP49356 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTBP49356 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTBP49356 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTBP49356 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTBP49356 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTBP49356 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTBP49356 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTBP49356 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTBP49356 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTBP49356 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTBP49356 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTBP49356 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTBP49356 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTBP49356 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTBP49356 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTBP49356 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTBP49356 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTBP49356 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTBP49356 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTBP49356 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTBP49356 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTBP49356 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTBP49356 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTBP49356 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTBP49356 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTBP49356 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTBP49356 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTBP49356 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTBP49356 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTBP49356 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTBP49356 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTBP49356 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTBP49356 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FNTBP49356 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTBP49356 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTBP49356 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTBP49356 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTBP49356 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTBP49356 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTBP49356 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTBP49356 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTBP49356 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTBP49356 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTBP49356 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTBP49356 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTBP49356 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTBP49356 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTBP49356 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTBP49356 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTBP49356 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTBP49356 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTBP49356 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTBP49356 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTBP49356 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTBP49356 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTBP49356 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTBP49356 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTBP49356 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTBP49356 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FNTBP49356 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms