Protein–RNA interactions for Protein: P48730

CSNK1D, Casein kinase I isoform delta, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1DP48730 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CSNK1DP48730 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms