Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PPARGP37231 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PPARGP37231 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PPARGP37231 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PPARGP37231 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PPARGP37231 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PPARGP37231 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PPARGP37231 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PPARGP37231 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PPARGP37231 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PPARGP37231 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PPARGP37231 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PPARGP37231 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PPARGP37231 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PPARGP37231 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PPARGP37231 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PPARGP37231 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PPARGP37231 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PPARGP37231 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PPARGP37231 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PPARGP37231 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PPARGP37231 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PPARGP37231 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PPARGP37231 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PPARGP37231 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PPARGP37231 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PPARGP37231 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PPARGP37231 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PPARGP37231 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PPARGP37231 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PPARGP37231 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PPARGP37231 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PPARGP37231 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PPARGP37231 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PPARGP37231 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PPARGP37231 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PPARGP37231 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PPARGP37231 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PPARGP37231 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PPARGP37231 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PPARGP37231 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PPARGP37231 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PPARGP37231 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PPARGP37231 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PPARGP37231 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PPARGP37231 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PPARGP37231 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PPARGP37231 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PPARGP37231 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PPARGP37231 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PPARGP37231 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PPARGP37231 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PPARGP37231 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PPARGP37231 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PPARGP37231 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PPARGP37231 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PPARGP37231 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PPARGP37231 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PPARGP37231 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PPARGP37231 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PPARGP37231 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PPARGP37231 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PPARGP37231 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PPARGP37231 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PPARGP37231 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PPARGP37231 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PPARGP37231 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PPARGP37231 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PPARGP37231 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PPARGP37231 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PPARGP37231 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PPARGP37231 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PPARGP37231 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PPARGP37231 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PPARGP37231 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
PPARGP37231 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PPARGP37231 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PPARGP37231 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PPARGP37231 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PPARGP37231 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PPARGP37231 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PPARGP37231 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PPARGP37231 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PPARGP37231 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PPARGP37231 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PPARGP37231 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PPARGP37231 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PPARGP37231 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PPARGP37231 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PPARGP37231 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PPARGP37231 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PPARGP37231 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PPARGP37231 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PPARGP37231 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PPARGP37231 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PPARGP37231 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PPARGP37231 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PPARGP37231 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PPARGP37231 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PPARGP37231 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms