Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HOXD13P35453 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms