Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 CU638689.4-208ENST00000623324 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 CU634019.6-203ENST00000624728 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 AL513283.1-201ENST00000441790 1087 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 AL117378.2-201ENST00000622916 1337 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXB3P14651 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HOXB3P14651 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms