Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BMP3P12645 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BMP3P12645 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BMP3P12645 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BMP3P12645 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BMP3P12645 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BMP3P12645 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BMP3P12645 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BMP3P12645 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BMP3P12645 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BMP3P12645 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BMP3P12645 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BMP3P12645 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BMP3P12645 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BMP3P12645 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BMP3P12645 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BMP3P12645 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BMP3P12645 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BMP3P12645 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BMP3P12645 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BMP3P12645 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BMP3P12645 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BMP3P12645 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BMP3P12645 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
BMP3P12645 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BMP3P12645 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BMP3P12645 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BMP3P12645 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BMP3P12645 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BMP3P12645 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BMP3P12645 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BMP3P12645 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BMP3P12645 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BMP3P12645 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BMP3P12645 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BMP3P12645 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BMP3P12645 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BMP3P12645 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BMP3P12645 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BMP3P12645 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BMP3P12645 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
BMP3P12645 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BMP3P12645 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BMP3P12645 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BMP3P12645 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BMP3P12645 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BMP3P12645 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BMP3P12645 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BMP3P12645 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BMP3P12645 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BMP3P12645 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BMP3P12645 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BMP3P12645 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BMP3P12645 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BMP3P12645 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BMP3P12645 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BMP3P12645 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BMP3P12645 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BMP3P12645 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BMP3P12645 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BMP3P12645 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BMP3P12645 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BMP3P12645 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
BMP3P12645 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BMP3P12645 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BMP3P12645 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BMP3P12645 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BMP3P12645 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BMP3P12645 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BMP3P12645 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BMP3P12645 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BMP3P12645 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BMP3P12645 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BMP3P12645 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BMP3P12645 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BMP3P12645 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BMP3P12645 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BMP3P12645 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BMP3P12645 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BMP3P12645 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BMP3P12645 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BMP3P12645 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BMP3P12645 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BMP3P12645 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BMP3P12645 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BMP3P12645 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BMP3P12645 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BMP3P12645 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BMP3P12645 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BMP3P12645 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BMP3P12645 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BMP3P12645 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BMP3P12645 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BMP3P12645 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BMP3P12645 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BMP3P12645 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BMP3P12645 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BMP3P12645 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BMP3P12645 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BMP3P12645 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms