Protein–RNA interactions for Protein: P0DP24

CALM2, Calmodulin-2, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM2P0DP24 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALM2P0DP24 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALM2P0DP24 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALM2P0DP24 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CALM2P0DP24 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALM2P0DP24 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALM2P0DP24 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALM2P0DP24 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALM2P0DP24 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALM2P0DP24 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALM2P0DP24 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALM2P0DP24 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALM2P0DP24 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALM2P0DP24 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALM2P0DP24 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALM2P0DP24 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALM2P0DP24 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CALM2P0DP24 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALM2P0DP24 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALM2P0DP24 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALM2P0DP24 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALM2P0DP24 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALM2P0DP24 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALM2P0DP24 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALM2P0DP24 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALM2P0DP24 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALM2P0DP24 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALM2P0DP24 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CALM2P0DP24 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALM2P0DP24 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALM2P0DP24 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALM2P0DP24 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALM2P0DP24 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALM2P0DP24 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALM2P0DP24 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALM2P0DP24 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALM2P0DP24 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALM2P0DP24 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALM2P0DP24 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CALM2P0DP24 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CALM2P0DP24 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALM2P0DP24 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALM2P0DP24 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALM2P0DP24 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALM2P0DP24 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALM2P0DP24 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALM2P0DP24 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALM2P0DP24 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALM2P0DP24 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CALM2P0DP24 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALM2P0DP24 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALM2P0DP24 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALM2P0DP24 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALM2P0DP24 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALM2P0DP24 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALM2P0DP24 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALM2P0DP24 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALM2P0DP24 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALM2P0DP24 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALM2P0DP24 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALM2P0DP24 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALM2P0DP24 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALM2P0DP24 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALM2P0DP24 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALM2P0DP24 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALM2P0DP24 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALM2P0DP24 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALM2P0DP24 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALM2P0DP24 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CALM2P0DP24 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALM2P0DP24 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALM2P0DP24 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALM2P0DP24 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALM2P0DP24 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALM2P0DP24 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALM2P0DP24 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALM2P0DP24 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALM2P0DP24 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALM2P0DP24 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CALM2P0DP24 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALM2P0DP24 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALM2P0DP24 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALM2P0DP24 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALM2P0DP24 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALM2P0DP24 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALM2P0DP24 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALM2P0DP24 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALM2P0DP24 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALM2P0DP24 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CALM2P0DP24 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALM2P0DP24 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALM2P0DP24 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALM2P0DP24 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALM2P0DP24 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CALM2P0DP24 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALM2P0DP24 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALM2P0DP24 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALM2P0DP24 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALM2P0DP24 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALM2P0DP24 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms