Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAVP06756 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAVP06756 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAVP06756 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAVP06756 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAVP06756 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAVP06756 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAVP06756 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAVP06756 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAVP06756 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAVP06756 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAVP06756 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAVP06756 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAVP06756 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAVP06756 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAVP06756 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAVP06756 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAVP06756 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAVP06756 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAVP06756 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAVP06756 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAVP06756 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAVP06756 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAVP06756 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAVP06756 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAVP06756 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAVP06756 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAVP06756 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAVP06756 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAVP06756 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAVP06756 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ITGAVP06756 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGAVP06756 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGAVP06756 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGAVP06756 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGAVP06756 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGAVP06756 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGAVP06756 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGAVP06756 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGAVP06756 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGAVP06756 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGAVP06756 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGAVP06756 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGAVP06756 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGAVP06756 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGAVP06756 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGAVP06756 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGAVP06756 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGAVP06756 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGAVP06756 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGAVP06756 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGAVP06756 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGAVP06756 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGAVP06756 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGAVP06756 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGAVP06756 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGAVP06756 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGAVP06756 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGAVP06756 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAVP06756 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms