Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SERPINC1P01008 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms