Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POP4O95707 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
POP4O95707 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
POP4O95707 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POP4O95707 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
POP4O95707 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POP4O95707 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POP4O95707 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POP4O95707 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POP4O95707 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POP4O95707 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
POP4O95707 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POP4O95707 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POP4O95707 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POP4O95707 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
POP4O95707 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POP4O95707 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POP4O95707 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POP4O95707 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POP4O95707 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POP4O95707 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POP4O95707 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POP4O95707 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POP4O95707 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POP4O95707 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POP4O95707 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POP4O95707 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POP4O95707 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POP4O95707 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POP4O95707 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POP4O95707 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POP4O95707 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POP4O95707 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POP4O95707 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POP4O95707 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POP4O95707 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POP4O95707 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POP4O95707 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POP4O95707 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POP4O95707 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POP4O95707 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POP4O95707 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
POP4O95707 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POP4O95707 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POP4O95707 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POP4O95707 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POP4O95707 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POP4O95707 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POP4O95707 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POP4O95707 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POP4O95707 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POP4O95707 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POP4O95707 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POP4O95707 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POP4O95707 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POP4O95707 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POP4O95707 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POP4O95707 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POP4O95707 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POP4O95707 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POP4O95707 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POP4O95707 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POP4O95707 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POP4O95707 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POP4O95707 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
POP4O95707 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POP4O95707 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POP4O95707 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POP4O95707 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
POP4O95707 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POP4O95707 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POP4O95707 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POP4O95707 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POP4O95707 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
POP4O95707 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POP4O95707 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POP4O95707 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POP4O95707 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POP4O95707 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POP4O95707 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POP4O95707 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POP4O95707 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POP4O95707 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POP4O95707 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POP4O95707 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POP4O95707 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POP4O95707 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POP4O95707 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POP4O95707 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POP4O95707 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POP4O95707 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POP4O95707 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POP4O95707 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POP4O95707 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POP4O95707 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POP4O95707 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POP4O95707 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POP4O95707 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POP4O95707 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POP4O95707 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms