Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMUO75648 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMUO75648 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMUO75648 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMUO75648 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMUO75648 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMUO75648 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMUO75648 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMUO75648 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMUO75648 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMUO75648 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMUO75648 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMUO75648 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMUO75648 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMUO75648 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMUO75648 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMUO75648 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMUO75648 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMUO75648 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMUO75648 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMUO75648 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMUO75648 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMUO75648 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMUO75648 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMUO75648 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TRMUO75648 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRMUO75648 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRMUO75648 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRMUO75648 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRMUO75648 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRMUO75648 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TRMUO75648 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TRMUO75648 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRMUO75648 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRMUO75648 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRMUO75648 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRMUO75648 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRMUO75648 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRMUO75648 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRMUO75648 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRMUO75648 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRMUO75648 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRMUO75648 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRMUO75648 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRMUO75648 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRMUO75648 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRMUO75648 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRMUO75648 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRMUO75648 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRMUO75648 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRMUO75648 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRMUO75648 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRMUO75648 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRMUO75648 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRMUO75648 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRMUO75648 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRMUO75648 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRMUO75648 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TRMUO75648 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRMUO75648 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRMUO75648 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TRMUO75648 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRMUO75648 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRMUO75648 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRMUO75648 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRMUO75648 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TRMUO75648 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRMUO75648 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRMUO75648 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRMUO75648 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRMUO75648 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRMUO75648 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRMUO75648 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRMUO75648 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRMUO75648 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRMUO75648 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRMUO75648 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRMUO75648 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRMUO75648 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRMUO75648 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRMUO75648 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRMUO75648 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRMUO75648 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRMUO75648 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRMUO75648 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRMUO75648 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRMUO75648 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRMUO75648 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRMUO75648 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRMUO75648 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRMUO75648 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRMUO75648 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRMUO75648 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRMUO75648 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRMUO75648 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRMUO75648 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRMUO75648 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRMUO75648 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRMUO75648 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRMUO75648 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms