Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SCN2BO60939 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SCN2BO60939 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms